Protein–RNA interactions for Protein: P61021

Rab5b, Ras-related protein Rab-5B, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5bP61021 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5bP61021 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5bP61021 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5bP61021 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5bP61021 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5bP61021 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5bP61021 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rab5bP61021 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab5bP61021 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms