Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdrg1P59048 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdrg1P59048 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdrg1P59048 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pdrg1P59048 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdrg1P59048 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdrg1P59048 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdrg1P59048 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdrg1P59048 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdrg1P59048 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdrg1P59048 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdrg1P59048 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdrg1P59048 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdrg1P59048 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdrg1P59048 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdrg1P59048 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdrg1P59048 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdrg1P59048 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdrg1P59048 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdrg1P59048 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdrg1P59048 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdrg1P59048 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdrg1P59048 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdrg1P59048 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdrg1P59048 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdrg1P59048 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdrg1P59048 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdrg1P59048 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdrg1P59048 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdrg1P59048 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdrg1P59048 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdrg1P59048 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms