Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Setd4P58467 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms