Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms