Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp25P57080 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp25P57080 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp25P57080 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp25P57080 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp25P57080 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp25P57080 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp25P57080 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp25P57080 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms