Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Bace1P56818 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bace1P56818 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bace1P56818 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bace1P56818 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bace1P56818 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bace1P56818 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Bace1P56818 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bace1P56818 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bace1P56818 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms