Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SmoP56726 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmoP56726 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SmoP56726 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmoP56726 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmoP56726 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmoP56726 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmoP56726 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmoP56726 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SmoP56726 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmoP56726 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmoP56726 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmoP56726 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmoP56726 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmoP56726 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmoP56726 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmoP56726 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmoP56726 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmoP56726 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmoP56726 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmoP56726 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmoP56726 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmoP56726 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmoP56726 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmoP56726 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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