Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rad23aP54726 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rad23aP54726 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms