Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Dbx1P52950 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Dbx1P52950 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Dbx1P52950 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Dbx1P52950 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Dbx1P52950 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Dbx1P52950 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dbx1P52950 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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