Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClgnP52194 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClgnP52194 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms