Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa6P50704 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa6P50704 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Defa6P50704 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa6P50704 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms