Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms