Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpreP49446 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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PtpreP49446 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpreP49446 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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PtpreP49446 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpreP49446 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpreP49446 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpreP49446 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpreP49446 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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