Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp3P49194 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms