Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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