Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msh2P43247 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msh2P43247 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msh2P43247 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msh2P43247 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msh2P43247 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Msh2P43247 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msh2P43247 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Msh2P43247 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msh2P43247 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msh2P43247 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Msh2P43247 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Msh2P43247 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Msh2P43247 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msh2P43247 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msh2P43247 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msh2P43247 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Msh2P43247 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Msh2P43247 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msh2P43247 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msh2P43247 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msh2P43247 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msh2P43247 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Msh2P43247 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msh2P43247 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msh2P43247 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Msh2P43247 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Msh2P43247 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms