Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Tnfsf9P41274 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Tnfsf9P41274 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Tnfsf9P41274 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Tnfsf9P41274 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tnfsf9P41274 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Tnfsf9P41274 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tnfsf9P41274 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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