Protein–RNA interactions for Protein: P41158

Elk4, ETS domain-containing protein Elk-4, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk4P41158 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Elk4P41158 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Elk4P41158 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Elk4P41158 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Elk4P41158 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Elk4P41158 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Elk4P41158 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Elk4P41158 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Elk4P41158 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Elk4P41158 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Elk4P41158 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Elk4P41158 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Elk4P41158 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Elk4P41158 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Elk4P41158 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Elk4P41158 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Elk4P41158 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Elk4P41158 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Elk4P41158 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Elk4P41158 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Elk4P41158 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Elk4P41158 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Elk4P41158 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Elk4P41158 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Elk4P41158 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Elk4P41158 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Elk4P41158 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Elk4P41158 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Elk4P41158 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Elk4P41158 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Elk4P41158 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Elk4P41158 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Elk4P41158 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Elk4P41158 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Elk4P41158 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Elk4P41158 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
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Elk4P41158 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Elk4P41158 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Elk4P41158 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Elk4P41158 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Elk4P41158 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Elk4P41158 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Elk4P41158 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Elk4P41158 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms