Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Chd1P40201 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chd1P40201 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chd1P40201 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chd1P40201 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chd1P40201 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Chd1P40201 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chd1P40201 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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