Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grin2aP35436 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grin2aP35436 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms