Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms