Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc10P31257 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms