Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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