Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BgnP28653 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BgnP28653 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BgnP28653 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms