Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms