Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdk11bP24788 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms