Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tpm3P21107 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms