Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms