Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P20040 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P20040 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P20040 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P20040 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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