Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ms4a1P19437 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ms4a1P19437 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms