Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms