Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpraP18052 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtpraP18052 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpraP18052 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpraP18052 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpraP18052 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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