Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms