Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gata1P17679 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms