Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Irf1P15314 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Irf1P15314 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Irf1P15314 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Irf1P15314 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf1P15314 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf1P15314 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf1P15314 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms