Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms