Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcp1P11983 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms