Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

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Length 1,281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PolP11369 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PolP11369 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PolP11369 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PolP11369 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PolP11369 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PolP11369 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PolP11369 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PolP11369 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PolP11369 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PolP11369 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PolP11369 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP11369 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP11369 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP11369 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP11369 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP11369 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP11369 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP11369 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP11369 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP11369 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP11369 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP11369 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP11369 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP11369 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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PolP11369 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP11369 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PolP11369 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP11369 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PolP11369 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP11369 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PolP11369 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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PolP11369 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP11369 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PolP11369 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP11369 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP11369 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP11369 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP11369 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PolP11369 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PolP11369 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PolP11369 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PolP11369 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PolP11369 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PolP11369 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PolP11369 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PolP11369 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PolP11369 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PolP11369 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PolP11369 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PolP11369 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PolP11369 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PolP11369 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PolP11369 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PolP11369 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PolP11369 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PolP11369 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PolP11369 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PolP11369 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PolP11369 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PolP11369 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PolP11369 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PolP11369 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PolP11369 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PolP11369 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PolP11369 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PolP11369 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PolP11369 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PolP11369 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PolP11369 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PolP11369 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PolP11369 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PolP11369 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PolP11369 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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