Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms