Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prf1P10820 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prf1P10820 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prf1P10820 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prf1P10820 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prf1P10820 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prf1P10820 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prf1P10820 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prf1P10820 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.8 ms