Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 2810404M03Rik-201ENSMUST00000188324 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxb4P10284 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms