Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01853 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01853 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P01853 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01853 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01853 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01853 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01853 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01853 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01853 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01853 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01853 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01853 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01853 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01853 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01853 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P01853 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P01853 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P01853 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P01853 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms