Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01648 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01648 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01648 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01648 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01648 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01648 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P01648 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01648 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01648 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01648 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01648 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01648 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01648 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01648 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01648 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01648 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01648 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01648 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01648 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01648 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01648 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01648 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P01648 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01648 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
P01648 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01648 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01648 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01648 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01648 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01648 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01648 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01648 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01648 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01648 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
P01648 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01648 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01648 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01648 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01648 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01648 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01648 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01648 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01648 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01648 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01648 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01648 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
P01648 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01648 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
P01648 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01648 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01648 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01648 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01648 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01648 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01648 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01648 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01648 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01648 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01648 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01648 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01648 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01648 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01648 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
P01648 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01648 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01648 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01648 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01648 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01648 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01648 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01648 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01648 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01648 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01648 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01648 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01648 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01648 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01648 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
P01648 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01648 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01648 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01648 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01648 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01648 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01648 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01648 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01648 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01648 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01648 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01648 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01648 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01648 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01648 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01648 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01648 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01648 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01648 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01648 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01648 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms