Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ifnb1P01575 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnb1P01575 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms