Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl20O89093 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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