Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CopeO89079 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CopeO89079 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CopeO89079 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CopeO89079 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CopeO89079 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CopeO89079 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CopeO89079 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CopeO89079 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CopeO89079 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CopeO89079 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CopeO89079 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CopeO89079 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CopeO89079 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CopeO89079 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CopeO89079 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CopeO89079 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CopeO89079 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CopeO89079 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CopeO89079 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CopeO89079 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CopeO89079 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CopeO89079 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CopeO89079 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CopeO89079 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CopeO89079 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopeO89079 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopeO89079 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms