Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
JtbO88824 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
JtbO88824 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
JtbO88824 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
JtbO88824 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
JtbO88824 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
JtbO88824 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
JtbO88824 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
JtbO88824 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
JtbO88824 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
JtbO88824 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
JtbO88824 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
JtbO88824 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
JtbO88824 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
JtbO88824 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
JtbO88824 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
JtbO88824 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
JtbO88824 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
JtbO88824 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
JtbO88824 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
JtbO88824 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
JtbO88824 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
JtbO88824 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
JtbO88824 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
JtbO88824 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
JtbO88824 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
JtbO88824 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
JtbO88824 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
JtbO88824 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
JtbO88824 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
JtbO88824 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
JtbO88824 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
JtbO88824 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
JtbO88824 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
JtbO88824 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
JtbO88824 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
JtbO88824 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
JtbO88824 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
JtbO88824 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
JtbO88824 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
JtbO88824 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
JtbO88824 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
JtbO88824 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
JtbO88824 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
JtbO88824 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
JtbO88824 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
JtbO88824 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
JtbO88824 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
JtbO88824 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
JtbO88824 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
JtbO88824 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
JtbO88824 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
JtbO88824 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
JtbO88824 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
JtbO88824 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
JtbO88824 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
JtbO88824 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
JtbO88824 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
JtbO88824 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
JtbO88824 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
JtbO88824 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
JtbO88824 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
JtbO88824 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
JtbO88824 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
JtbO88824 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
JtbO88824 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
JtbO88824 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms