Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BlmO88700 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BlmO88700 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BlmO88700 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BlmO88700 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BlmO88700 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BlmO88700 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BlmO88700 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BlmO88700 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BlmO88700 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BlmO88700 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BlmO88700 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BlmO88700 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BlmO88700 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BlmO88700 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BlmO88700 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BlmO88700 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BlmO88700 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BlmO88700 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BlmO88700 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BlmO88700 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BlmO88700 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BlmO88700 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BlmO88700 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BlmO88700 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BlmO88700 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BlmO88700 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BlmO88700 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BlmO88700 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BlmO88700 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BlmO88700 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BlmO88700 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BlmO88700 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BlmO88700 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BlmO88700 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BlmO88700 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BlmO88700 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BlmO88700 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BlmO88700 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BlmO88700 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BlmO88700 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BlmO88700 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BlmO88700 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BlmO88700 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BlmO88700 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BlmO88700 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BlmO88700 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BlmO88700 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BlmO88700 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BlmO88700 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BlmO88700 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BlmO88700 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BlmO88700 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BlmO88700 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BlmO88700 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BlmO88700 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BlmO88700 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BlmO88700 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BlmO88700 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BlmO88700 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BlmO88700 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BlmO88700 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BlmO88700 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BlmO88700 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BlmO88700 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BlmO88700 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BlmO88700 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BlmO88700 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BlmO88700 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BlmO88700 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BlmO88700 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BlmO88700 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BlmO88700 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BlmO88700 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BlmO88700 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BlmO88700 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BlmO88700 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BlmO88700 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BlmO88700 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BlmO88700 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BlmO88700 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BlmO88700 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BlmO88700 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BlmO88700 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BlmO88700 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BlmO88700 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BlmO88700 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BlmO88700 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BlmO88700 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BlmO88700 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BlmO88700 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BlmO88700 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BlmO88700 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BlmO88700 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BlmO88700 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BlmO88700 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BlmO88700 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BlmO88700 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BlmO88700 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BlmO88700 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms