Protein–RNA interactions for Protein: O88532

Zfr, Zinc finger RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfrO88532 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZfrO88532 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZfrO88532 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZfrO88532 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZfrO88532 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZfrO88532 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZfrO88532 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZfrO88532 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZfrO88532 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZfrO88532 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZfrO88532 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZfrO88532 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZfrO88532 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZfrO88532 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZfrO88532 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZfrO88532 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ZfrO88532 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ZfrO88532 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZfrO88532 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZfrO88532 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms