Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnmt3aO88508 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnmt3aO88508 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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